简单直接的回答是：绝大多数以“分公司”名义进行的“资质合作”都是违法的，本质上属于被严格禁止的“资质挂靠”或“资质出借”。

下面为你详细拆解这种合作的法律边界、风险和建议。

合法的分公司运营 vs. 非法的资质合作

关键在于区分分公司是总公司真实、统一管理的组成部分，还是仅仅作为一个出借资质的“壳”。

“资质合作分公司”的主要风险

如果操作模式落入上述“非法”范畴，将面临以下重大风险：

1. 合同无效，财产损失：一旦被认定为资质挂靠，双方签订的《合作协议》《内部承包合同》等将被认定为无效合同。根据《民法典》，因无效合同取得的财产（如加盟费、管理费）应当返还，且根据过错分担损失，投入的成本可能无法收回。

2. 行政处罚，资质受损：对出借资质的公司，住建部门可依法给予罚款、停业整顿、降低资质等级、甚至吊销资质证书的处罚。这将影响公司长远发展。

3. 质量与安全责任：由于管理脱节，工程质量和安全风险极大。一旦发生事故，总公司作为法律主体将承担首要赔偿责任，且可能被追究连带责任。

4. 刑事风险：如果发生重大安全事故，相关负责人还可能被追究刑事责任。

给企业的合规建议

如果你希望通过分公司形式拓展业务，务必确保做到以下几点：

• 坚持以总公司名义开展业务：在投标、签订合同、开具发票等所有对外法律文件中，必须使用总公司的名义，分公司可作为具体实施团队。

• 确保管理实质化：总公司必须对分公司的人事、财务、工程质量、安全进行实质性统一管理。关键岗位人员应由总公司派遣或认命，并保持社保关系的一致性。

• 财务收支统一：项目工程款应统一进入总公司账户，进行规范核算，再由总公司根据内部规定划拨资金，避免分公司完全独立核算。

• 警惕“挂靠”陷阱：对于任何提出“只交管理费，其他全包”的合作方，要保持高度警惕，这基本是挂靠的典型特征。

总结与提醒

建筑资质是行政许可是不可分割、不能私相授受的。所谓的“资质合作分公司”，其目的如果是让无资质方独立使用资质，就是典型的违法行为。

在这种合作中，通常“出借方”（总公司）和“借用方”（合作个人或团队）都面临巨大法律风险，最终的结果往往是“双输”。对于真正的分公司设立与运营，务必回归法律本意，确保其是公司组织架构的真实延伸，而非规避法律监管的工具。

如果你需要进一步了解在特定省份设立合规分公司的具体流程，或者如何构建合法的内部承包模式，我可以为你提供更具体的指引。