具体来说,分公司在注销前需要全面梳理尚未结算的工程款项,并与总公司进行沟通协商。双方应当就工程款的结算时间、支付方式等达成一致,并按照约定的程序进行操作。一般情况下,总公司会在收到分公司提供的有效发票后的7个工作日内,将工程款项转入分公司预先指定的账户。这样不仅可以保证款项的及时到账,也能有效规避出现拖欠的风险。